完全に初期化する（すべてのイメージ、コンテナなど削除）

 docker stop $(docker ps -aq)
 docker rm $(docker ps -aq)
 
 docker network prune -f
 docker rmi -f $(docker images --filter dangling=true -qa)
 docker volume rm $(docker volume ls --filter dangling=true -q)
 docker rmi -f $(docker images -qa)

参考

https://stackoverflow.com/questions/34658836/docker-is-in-volume-in-use-but-no-docker-containers