add -Uとadd -Aとadd .

git add -U

• 変更されたファイル
• 削除されたファイル

git add -A

• 変更されたファイル
• 削除されたファイル
• 新規に作成されたファイル

git add .

• （カレントディレクトリ以下にある、）
• 変更されたファイル
• 削除されたファイル
• 新規に作成されたファイル